Для цього необхідно об'єднати вже існуючі системи контролю над експортом, імпортом, транзитом і забезпечити обмін електронною інформацією між усіма органами та суб'єктами, які задіяні в експортно-імпортних операціях.
Зараз у рамках створення e-Customs Держмитслужба впроваджує у своїх структурних підрозділах електронні підписи, і вже провела тестування сумісності своїх систем контролю за переміщенням вантажів з новою комп'ютеризованою транзитною системою Євросоюзу.
Надалі, для впровадження "Електронної митниці" службі необхідно удосконалити механізм електронного декларування, забезпечити взаємодію її телекомунікаційної системи з іншими системами українських органів влади, завершити створення системи аналізу ризиків і впровадити електронний документообіг з усіма митними органами країни.